Los cuerpos Académicos son grupos de Profesores de Tiempo Completo (PTC) que comparte una o varias Líneas de Generación o Aplicación Innovadora del Conocimiento (LGAC), las cuales se orientan principalmente a la asimilación, desarrollo, transferencia y mejora de tecnologías y procesos para apoyar al sector productivo y de servicios de una región en particular. También comparten objetivos y metas académicas.

La Universidad cuenta actualmente con un Cuerpo Académico en Consolidación (CAEC) y ocho en Formación (CAEF), dando un total de nueve CA reconocidos por parte de PRODEP, mismos que se enlistan a continuación: